Les scientifiques ont enregistré des densités dépassant 25 individus par kilomètre lors des relevés de la saison sèche au début des années 2000, un chiffre qui reste exact aujourd'hui. Les eaux saumâtres de la rivière, la température stable toute l'année et la proximité des mangroves protégées créent un habitat idéal pour le Crocodylus acutus, une espèce pouvant dépasser cinq mètres de long et peser plus de 450 kilogrammes.
Le bassin de Tárcoles a attiré l'attention internationale dans les années 1990, lorsque des biologistes ont documenté des taux de reproduction inhabituellement élevés chez les crocodiles femelles de l'estuaire. Les sites de nidification le long des berges sablonneuses et l'abondance de poissons, de crustacés et d'oiseaux échassiers ont fourni des sources de nourriture prévisibles permettant aux jeunes crocodiles d'atteindre la maturité plus rapidement que dans les environnements moins stables. Au milieu des années 2000, Tárcoles était devenu un point focal pour la recherche sur les crocodiles en Amérique centrale, avec des programmes de marquage révélant que certains individus restent dans la même section de rivière pendant des décennies.
Aujourd'hui, les visites des crocodiles sur la rivière Tárcoles fonctionnent du début de la matinée jusqu'à la fin de l'après-midi, bien que l'activité animale atteigne son apogée pendant les heures plus fraîches avant 10h00. Les opérateurs naviguent dans les canaux de l'estuaire à faible vitesse, permettant aux passagers d'observer les crocodiles se prélassant sur les vasières, immergés dans les bas-fonds avec seulement leurs yeux visibles, ou glissant dans l'eau plus profonde à l'approche du bateau. La largeur de la rivière se réduit à moins de 50 mètres par endroits, amenant les passagers à quelques mètres des reptiles.
L'estuaire abrite également plus de 350 espèces d'oiseaux répertoriées. Les aras rouges, les spatules rosées, les hérons savacous et les colibris de mangrove peuplent la canopée et les vasières, souvent visibles lors des mêmes excursions axées sur les crocodiles. La visite safari jungle et observation des oiseaux sur la rivière Tárcoles combine ces deux éléments, avec des guides formés pour identifier les chants et suivre les sites de nidification. Le rôle de la rivière en tant qu'escale migratoire pour les oiseaux de rivage ajoute une variété saisonnière aux observations, particulièrement entre novembre et mars.
Le pont enjambant la rivière Tárcoles sur la Route 34 offre un point de vue séparé où les crocodiles se rassemblent sous la structure, attirés par les restes de nourriture et l'ombre. Les opérateurs de visites font la distinction entre l'observation depuis le pont et les excursions en bateau, ces dernières donnant accès aux canaux de mangrove et aux tronçons en amont où les crocodiles nichent et où les jeunes individus se regroupent. La plupart des visites en bateau sur la rivière Tárcoles durent de 90 minutes à deux heures, avec un départ depuis les quais situés juste au sud du pont.
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